選擇性波峰焊提供了一種新的焊接手段，有著(zhù)手工焊、傳統波峰焊和通孔回流焊無(wú)可比擬的優(yōu)越性；但任何一種焊接手段都不可能是十全十美的，選擇性波峰焊也存在一些因設備特性決定了的“局限性”。

1、選擇性波峰焊的噴嘴只能上下、左右移動(dòng)，無(wú)實(shí)現3D轉動(dòng)，選擇性波峰焊的波峰是垂直波，不是橫向波（側向波），因此對于類(lèi)似安裝在微波腔體側壁上的電連接器、絕緣子及垂直安裝在母板上的子印制電路板上的元器件難以實(shí)施焊接，對于射頻連接器組件和多芯電纜組件也無(wú)法實(shí)施焊接，當然傳統波峰焊和回流焊也無(wú)法進(jìn)行；即使機器人焊接，也會(huì )有一定的“局限性”。

2、選擇性波峰焊的第二個(gè)局限性是產(chǎn)量。傳統波峰焊是整個(gè)電路板一次性焊接，選擇焊是逐點(diǎn)焊接或小噴嘴拖焊，但隨著(zhù)電裝行業(yè)的飛速發(fā)展，通孔元器件越來(lái)越少，選擇性波峰焊的產(chǎn)能通過(guò)模組化設計，多缸并行的改良，特別是德國技術(shù)的創(chuàng )新，其產(chǎn)能已經(jīng)不能同日而語(yǔ)了。

3、選擇性波峰焊適應的元器件引腳間距（中心距）。在PCBA的高密度組裝中，電連接器及雙列直插式集成電路（DIP）的間距越來(lái)越小，電連接器及雙列直插式集成電路（DIP）引腳間距（中心距）已經(jīng)從常用的1.27mm減小到0.5mm甚至更??；這就給傳統的波峰焊和選擇性波峰焊帶來(lái)了挑戰。當電連接器的引腳間距小于1.0mm甚至到0.5mm時(shí)，若使用逐點(diǎn)焊接會(huì )受到波峰噴嘴尺寸的限制，若使用拖焊也會(huì )增加焊點(diǎn)橋連的缺陷，因此在高密度組裝中，選擇性波峰焊的缺點(diǎn)凸顯。

4、與傳統的波峰焊相比，由于選擇性焊接設備特有的焊點(diǎn)“瘦身”功能，它的焊接間距可以小于傳統的波峰焊；對于引腳距離大于或等于2mm的通孔元器件可以做到可靠焊接；對于引腳距離1~2mm的通孔元器件需要應用設備的焊點(diǎn)“瘦身”功能，做到可靠焊接；而對于引腳距離小于1mm的通孔元器件，需要設計特制的噴嘴和采取特殊的工藝，才能做到無(wú)缺陷焊接。

如果電連接器的中心距小于或等于0.5mm，設計上應選用更為先進(jìn)的無(wú)線(xiàn)纜連接技術(shù)。

5、選擇性波峰焊使用噴嘴進(jìn)行助焊劑自助噴涂及焊嘴自助焊接對PCB設計有嚴格的要求，其工藝技術(shù)也有很高的要求，但仍存在一定的焊接缺陷，如錫珠就是最難解決的一種。

6、設備昂貴，一臺低檔次的選擇性波峰焊設備需要差不多20萬(wàn)美元，而且選擇性波峰焊效率較低，目前最先進(jìn)的選擇性波峰焊需要5s的周期，對于通孔元器件較多的PCB來(lái)說(shuō)，在批量生產(chǎn)時(shí)根本無(wú)法跟上生產(chǎn)節拍，且成本巨大。